Die „Europäischen Wochen Passau“ haben in der katholischen Kirche Niederbayerns einen starken Partner. Allein 20 Veranstaltungen der Festspiele vom 18. Juni bis 25. Juli 1999 finden in Kirchen oder kirchlichen Räumen statt. Der Passauer Dom ist mehrfach Veranstaltungsort, unter anderem für das Eröffnungskonzert. Am Festgottesdienst im Rahmen der Europäischen Wochen wirken auch der Domchor und das Domorchester mit. Herausragende Konzerte finden auch in der Pfarrkirche Deggendorf, in der Basilika Niederaltaich und in der Studienkirche in Passau statt. Unter der Schirmherrschaft des griechischen Komponisten Mikis Theodorakis finden bei den heurigen 47. Europäischen Wochen Passau insgesamt 64 Einzelveranstaltungen aus den Bereichen Oper, Chor-, Solo- Kammerkonzert, Theater, Tanz, Lesung, Film, Vortrag und Ausstellung in den schönsten Kirchen, Klöstern, Schlössern, Burgen und Museen in Niederbayern, Oberösterreich und Südböhmen statt.