Wilhering ist eine Gründung der Brüder Ulrich und Cholo von Wilhering - Waxenberg, besiedelt wurde das Stift 1146 von Zisterziensern aus der Steiermark. Ende des 12. Jh. wurde mit dem Bau des Klosters und der Kirche begonnen. Aus dieser Zeit sind das Eingangsportal zur Stiftskirche sowie der Kreuzgang erhalten. Durch die kolonisatorische Tätigkeit im Mühlviertel blühte das Stift auf und konnte drei Tochtergründungen durchführen (u. a. Stift Engelszell). Türkenkriege und Reformation setzten dem Stift schwer zu, und als es wieder bergauf ging, zerstörte ein Brand Stift und Kirche. Aus den Ruinen wurde die heutige Rokokokirche geschaffen, der Neubau des Stiftes konnte damals nicht vollendet werden, der Westflügel wurde erst 1956 fertiggestellt.Im 2. Weltkrieg wurde das Stift aufgeho-ben, 1945 kehrten die Mönche zurück, das Gymnasium wurde wieder eröffnet.Heute hat Stift Wilhering 33 Konventangehörige, das Stift betreut 19 Pfarren.